A helyes antidepresszívum megválasztásánál a kezelőorvosa számos tényezőt vesz figyelembe, mint például az uralkodó és fő tüneteket, az előzményeket és eddigi tapasztalatait, a lehetséges mellékhatásokat, stb.

Az antidepresszívumokat hatásmecsanizmusuk alapján három fő csoportba soroljuk:

• szelektív szerotonin-visszavétel gátlók (SSRI): általában kevesebb mellékhatást okoznak
• klasszikus tri- és tetraciklikus antidepresszívumok (TCA): sokkal inkább lehetnek mellékhatásai, de súlyosabb esetekben hatékony lehet
• új és atípusos antidepresszánsok, amelyek többnyire jobban tolerálható szerek

Időnként a páciensek a természetes anyagokat részesítik előnyben, mint például az orbáncfű (hypericum perforatum) kivonatait. Ebben valójában természetes SSRI található, emiatt hatásos lehet. A gyógyszerek egy másik típusa a hangulatstabilizálók közé tartozik, melyeket főként bipoláris depresszió esetében alkalmazunk.